В сферата на растителната наука точното и ефективно откриване на РНК играе основна роля в разбирането на физиологията на растенията, диагностицирането на болести и генетичните изследвания. Традиционните методи за усилване и откриване на РНК често идват с ограничения като дълго време на обработка, сложни изисквания за оборудване и необходимостта от специализирани лаборатории. Това е мястото, където РНК изотермичния комплект за усилване влиза като игра - смяна. Като доставчик на тези комплекти, аз съм развълнуван да проуча как се представя комплектът за изотермично амплификация на РНК при откриване на растителна РНК.
Принципът на изотермичното усилване на РНК
Преди да се задълбочи в неговата ефективност при откриване на растителна РНК, е от съществено значение да се разбере принципът зад комплекта за изотермично амплификация на РНК. За разлика от често известната полимеразна верижна реакция (PCR), която изисква топлинно колоездене между различни температури за денатурация на ДНК, отгряване и удължаване, изотермичната амплификация се осъществява при постоянна температура. Тази простота елиминира необходимостта от скъпи термични колоездачи, което я прави по -достъпен за - ограничени настройки на сайта или ресурсите.
Има няколко изотермични техники за усилване, като контура, медиирана изотермична амплификация (LAMP) и амплификация на базата на нуклеинова киселина - базирана (NASBA), които често се използват в тези комплекти. LAMP, например, използва набор от специални праймери, които разпознават множество специфични последователности на целевата РНК. С помощта на нишката - изместваща ДНК полимераза, тя може бързо да усили целевата РНК при изотермични условия, като произвежда големи количества ДНК ампликони, които могат да бъдат открити лесно.
Предимства при откриване на растителна РНК
Чувствителност
Един от ключовите показатели за ефективност на всеки метод за откриване на РНК е чувствителността. Комплектът за изотермична амплификация на РНК демонстрира отлична чувствителност при откриване на растителна РНК. В растителни проучвания дори следи от специфична РНК, като тези от вирусни инфекции или редки генни експресии, могат да бъдат решаваща информация. Процесът на изотермична амплификация може експоненциално да усили тези ниски RNA с ниско изобилие до откриваеми нива.
Например, при откриване на растителни вируси, които често съществуват в много ниски титри в ранните етапи на инфекцията, комплектът може да вземе вирусната РНК с висока точност. Това ранно откриване е жизненоважно за предотвратяване на разпространението на растителни заболявания и гарантиране на здравето на културите.
Специфичност
Специфичността е друг решаващ аспект. Праймерите, използвани в комплекта за изотермична амплификация на РНК, са внимателно проектирани така, че да разпознаят само целевата растителна РНК. Тази специфичност на високо ниво намалява шансовете за фалшиви положителни резултати. В сложната РНК среда на растението, където има множество ендогенни РНК от различни гени и организми, способността за конкретно насочване към желаната РНК последователност е значително предимство.
Например, когато разграничават тясно свързани растителни вируси или откриват определен щам на вируса, специфичните праймери могат точно да разграничат целевата РНК от другите, като осигуряват надеждни резултати за идентифициране на патоген на растенията.
Скорост
Скоростта е забележително предимство на комплекта за изотермично амплификация на РНК при откриване на растителна РНК. Традиционните методи, базирани на PCR, могат да отнемат часове, включително приготвяне на проби, термичен цикъл и анализ на резултатите. За разлика от тях, изотермичното усилване може да постигне значително усилване само за 30 - 60 минути.
Това бързо време за изпълнение е изключително полезно в селскостопанските условия, където трябва да се вземат бързи решения по отношение на управлението на болестите на растенията. Например, в голяма мащабна оранжерия или ферма, ако растението показва симптоми на потенциална вирусна инфекция, комплектът за изотермично амплификация на РНК може да даде резултати в рамките на един час, което позволява на фермерите да предприемат незабавни действия за предотвратяване на разпространението на болестта.
Простота
Простотата на изотермичния комплект за усилване на РНК го прави приятелски настроен, дори и за не -експертни потребители. Тъй като работи при постоянна температура, не е необходимо да се настройват сложни параметри на топлинното колоездене. Реакционните компоненти обикновено се смесват предварително в комплекта, намалявайки шансовете за грешки по време на експеримента.
Тази простота означава, че откриването на растителна РНК може да се извърши на полето, директно на мястото на събирането на проби от растенията. Например, растителен развъдчик може да използва комплекта точно в полето, за да екранира бързо за наличие на желани генетични черти или заболявания в нови сортове растения.
Различни формати за откриване
Нашата компания предлага редица формати за откриване, за да отговори на различни нужди при откриване на растителна РНК.
Тестова лента за нуклеинова киселина
TheMIRA ДНК Изотермичен комплект за бързо амплификация Нуклеинова киселина Тест лентаОсигурява прост и визуален начин за откриване на амплифицирана растителна РНК. След реакцията на изотермична амплификация, реакционният продукт се добавя към тестовата лента. Подобно на тест за бременност, видима линия на лентата показва положителен резултат. Този формат е изключително удобен за откриване на сайтове, тъй като не изисква скъпо оборудване за четене на резултати. Може да се използва в отдалечени селскостопански райони или по време на теренни проучвания, където са необходими бързи и ясни резултати.
Откриване на флуоресценция
TheMIRA ДНК Изотермичен комплект за бързо амплификация флуоресценцияИзползва флуоресцентни багрила за откриване на амплифицираната растителна РНК. По време на процеса на изотермична амплификация флуоресцентното багрило се свързва към ново синтезираните ДНК ампликони и увеличаването на интензитета на флуоресценция може да бъде измерено с помощта на флуорометър. Този метод е по -количествен в сравнение с метода на тестовата лента. Той може да предостави информация за количеството на целевата РНК в пробата, което е полезно за изследвания върху нивата на генна експресия или вирусни титри в растенията.
Основен формат
TheMira ДНК изотермичен комплект за бързо усилванее по -традиционен формат, който може да се използва заедно с други методи за откриване, като гел електрофореза. След изотермичното амплификация реакционният продукт може да се изпълнява върху агарозен гел, за да визуализира амплифицираните ДНК ленти. Този формат е подходящ за повече лабораторен анализ на дълбочината, което позволява на изследователите да проучат допълнително характеристиките на амплифицираната РНК, като неговия размер и чистота.
Реални - световни приложения в растителни изследвания
В растителното генетично инженерство комплектът за изотермично амплификация на РНК се използва за откриване на експресията на трансгени в генетично модифицирани растения. Това помага на изследователите бързо да проверят дали въведените гени са правилно транскрибирани в РНК, което е от решаващо значение за успеха на процеса на генетична модификация.
За диагностицирането на болести на растенията, както беше споменато по -рано, откриването на вирусна или гъбична РНК в растенията е от съществено значение за предотвратяване на огнища на заболявания. Комплектът за изотермично амплификация на РНК може да се използва за скрининг на голям брой проби за растения за кратко време, което позволява ранно откриване и навременно лечение на заболявания.
При отглеждането на растенията комплектът може да се използва за откриване на специфични маркери на РНК, свързани с желаните черти, като устойчивост на болести или потенциал с висок добив. Чрез бързо идентифициране на растенията с тези черти, животновъдите могат да ускорят процеса на размножаване и да развият по -ефективно нови сортове растения.
Насърчаване на контакта за закупуване
Изотермичния комплект за амплификация на РНК предлага отлична производителност при откриване на растителна РНК по отношение на чувствителност, специфичност, скорост и простота. Ако участвате в изследвания на растенията, селското стопанство или всяка област, свързана с анализа на растителната РНК, нашите комплекти могат да бъдат безценен инструмент за вашата работа. Каним ви да се свържете с нас за допълнителна информация и да обсъдите вашите специфични изисквания. Независимо дали се нуждаете от покупка с голям мащаб за изследователски проект или малко количество за тестване на терен, ние сме готови да ви предоставим най -добрите решения и поддръжка.
ЛИТЕРАТУРА
- Notomi T, Okyama H, Masubuchi H, et al. Цикъл - медиирана изотермична амплификация на ДНК. Нуклеинови киселини Res. 2000; 28 (12): E63.
- Compton J. Последователност на нуклеинова киселина - базирана амплификация. Природа. 1991; 350 (6313): 91 - 92.
- Goto N, Nikkuni K, Hase T. Откриване на растителни вируси чрез методи на базата на нуклеинова киселина. J Gen Plant Pathol. 2009; 75 (6): 339 - 348.